《名侦探柯南：银翼的魔术师 2004》中，怪盗基德发出预告函，称将盗取铃木集团展出的宝石“命运的宝石”。柯南和小兰等人受邀来到飞机上，却发现基德早已混入其中。在飞行过程中，飞机遭遇各种意外，基德也不断设下谜题。随着宝石即将到手，一场惊心动魄的空中对决展开。与此同时，一个神秘组织也在暗中行动。柯南能否识破基德的诡计，保护宝石和众人的安全？而神秘组织的目的又是什么？在银翼之上，一场充满智慧与惊险的较量一触即发。