《我的队长不对劲》讲述了一段充满悬疑与温情的故事。在平凡的校园生活中，看似普通的高中队长林一航却有着不为人知的秘密。他的行为举止时常让人感到古怪，而新转来的学生林念发现了这一异常。随着两人逐渐接触，林念越发觉得林一航不对劲，但又说不上来哪里有问题。在探索的过程中，他们发现了学校背后隐藏的秘密，以及林一航身上背负的特殊使命。他们在这个过程中携手并肩，共同面对各种挑战和困难，也逐渐揭开了林一航神秘的面纱，一段扣人心弦又温暖人心的故事就此展开。